De kanselarij ondersteunt de leidend ambtenaar bij de uitvoering van zijn taak als secretaris van het College. Dit houdt in dat de kanselarij het besluitvormingsproces van het College van de Vlaamse Gemeenschapscommissie coördineert en opvolgt.
Het besluitvormingsproces verloopt via een maandelijkse collegevergadering. Tijdens zo'n collegevergadering worden gemiddeld een veertigtal collegebesluiten voorgelegd ter bespreking en goedkeuring.
Verder kan elk collegelid voor zijn eigen bevoegdheden en onder bepaalde voorwaarden beslissingen nemen (vanaf oktober 2005). Deze beslissingen vormen collegelidbesluiten.
De kanselarij zorgt voor de archivering en publicatie van de goedgekeurde college- en collegelidbesluiten.